Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc1a6O35544 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms