Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edil3O35474 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edil3O35474 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edil3O35474 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edil3O35474 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edil3O35474 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Edil3O35474 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms