Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-ObO35424 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-ObO35424 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms