Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bhlhe40O35185 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bhlhe40O35185 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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