Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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