Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kif3cO35066 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms