Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Casq1O09165 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Casq1O09165 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casq1O09165 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casq1O09165 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Casq1O09165 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms