Protein–RNA interactions for Protein: L7N471

Gm7980, Predicted gene 7980 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7980L7N471 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm7980L7N471 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm7980L7N471 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms