Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm3542K7N6U2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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