Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm2035J3QP87 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm2035J3QP87 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms