Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Gm20795J3QP49 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm20795J3QP49 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm20795J3QP49 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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