Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn34c2J3QNM1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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