Protein–RNA interactions for Protein: J3QN10

Gm16434, Predicted gene 16434, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16434J3QN10 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm16434J3QN10 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm16434J3QN10 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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