Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm11236J3QMS7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm11236J3QMS7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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