Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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