Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G3

Opcml, MCG9827, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OpcmlG5E8G3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
OpcmlG5E8G3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms