Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms