Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nccrp1G3X9C2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nccrp1G3X9C2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms