Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms