Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim55G3X8Y1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms