Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Srp72F8VQC1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Srp72F8VQC1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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