Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Farp1F8VPU2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms