Protein–RNA interactions for Protein: F7BCK0

Dcdc2b, Doublecortin domain-containing 2b (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcdc2bF7BCK0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dcdc2bF7BCK0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dcdc2bF7BCK0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dcdc2bF7BCK0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dcdc2bF7BCK0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dcdc2bF7BCK0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dcdc2bF7BCK0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dcdc2bF7BCK0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dcdc2bF7BCK0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dcdc2bF7BCK0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dcdc2bF7BCK0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dcdc2bF7BCK0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dcdc2bF7BCK0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dcdc2bF7BCK0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms