Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms