Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28374F6SG70 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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