Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syngap1F6SEU4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syngap1F6SEU4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms