Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd7E9Q9W7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd7E9Q9W7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pdzd7E9Q9W7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pdzd7E9Q9W7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pdzd7E9Q9W7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pdzd7E9Q9W7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdzd7E9Q9W7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pdzd7E9Q9W7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pdzd7E9Q9W7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Pdzd7E9Q9W7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Pdzd7E9Q9W7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Pdzd7E9Q9W7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd7E9Q9W7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pdzd7E9Q9W7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pdzd7E9Q9W7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd7E9Q9W7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pdzd7E9Q9W7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pdzd7E9Q9W7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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