Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TrdnE9Q9K5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrdnE9Q9K5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms