Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
6030445D17RikE9Q8F9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms