Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf169E9Q7F2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf169E9Q7F2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms