Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BC005561E9Q5E2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC005561E9Q5E2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms