Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm20518E9Q548 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm20518E9Q548 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm20518E9Q548 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm20518E9Q548 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm20518E9Q548 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm20518E9Q548 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Gm20518E9Q548 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm20518E9Q548 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm20518E9Q548 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm20518E9Q548 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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