Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trip11E9Q512 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip11E9Q512 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms