Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Brd1E9PZ26 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms