Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc144bE9PVZ3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms