Protein–RNA interactions for Protein: E9PV04

Gm8994, Predicted gene 8994, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8994E9PV04 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8994E9PV04 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8994E9PV04 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms