Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cngb1E1AZ71 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC25■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cngb1E1AZ71 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms