Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Klhl3E0CZ16 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Klhl3E0CZ16 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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