Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Vpreb3D3Z6J4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms