Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm3543D3Z235 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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