Protein–RNA interactions for Protein: D3YYU8

Obsl1, Obscurin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obsl1D3YYU8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Obsl1D3YYU8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms