Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm3259D3YUK0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm3259D3YUK0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm3259D3YUK0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm3259D3YUK0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm3259D3YUK0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm3259D3YUK0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm3259D3YUK0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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