Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmf1B9EKI3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms