Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyp26c1B2RXA7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms