Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah3B2RWG3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah3B2RWG3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms