Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Usf3B2RUQ2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usf3B2RUQ2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms