Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apba1B2RUJ5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apba1B2RUJ5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms