Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PtprbB2RU80 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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PtprbB2RU80 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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PtprbB2RU80 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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PtprbB2RU80 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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PtprbB2RU80 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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