Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Apol7aB2RT54 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apol7aB2RT54 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms