Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nfx1B1AY10 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms